自动化专业前身为1984年开设的热工计量测试专业和1986年开设的检测技术及仪器仪表专业，并于1996年合并为热工检测与自动控制专业，1999年更名为自动化专业，是本校第一批获得学士学位授予权的专业之一。2007年通过浙江省重点建设本科专业验收；2009年成为国家特色专业，并入选国家创新人才培养实验区；2011年列入教育部“卓越工程师”培养计划；2012年获批浙江省“十二五”优势专业；2013年获批教育部“十二五”专业综合改革试点，与企业合作建成全国工业自动化人才认证(IAAT)培训基地；2017年自动化专业继续获批浙江省“十三五”优势专业；2018年通过教育部工程教育专业认证；2019年获批国家级一流本科专业建设点。
自动化专业根据教育部通用专业规划，秉承学校“计量、质量、标准”办学特色，依托质量检验检疫行业背景，形成了“计量—控制—智能”相结合的特色人才培养模式。专业依托校内实验平台、科技创新实践平台、行业企业实践平台等三个实践平台，培养学生计量检测、自动控制系统工程实践能力。本专业与杭州和利时自动化有限公司合作共建了“十四五”省级大学生校外实践教育基地，并向学生开放了“灾害监测技术与仪器”国家地方联合工程实验室、教育部教育装备检验检测研究中心、“质量检测技术与仪器”浙江省协同创新中心、浙江省在线检测装备校准技术研究重点实验室等科研与工程创新平台。专业建立了恩智浦智能车创新平台、航模技术创新平台、机器人竞赛创新平台和西门子自动化实践平台等四大科技活动平台。四大平台的实验室使用面积超过1200平方米，涉及指导老师达到10位，对加入平台的学生采用每周集训、专题学习、校内比赛以及参加省内和全国竞赛等形式开展活动，有效提高了学生的专业实践兴趣、自学能力以及科技创新意识和创新实践能力。本专业学生通过上述平台的锻炼，工程应用和创新能力提高显著，近三年共有近150人次获得了省级及以上学科竞赛的奖励。
自动化专业依托“控制科学与工程”一级学科（2016、2022年均入选浙江省一流学科A类），2003年获批硕士学位授予权，2005年入选浙江省重点学科，目前拥有“控制科学与工程”学术学位硕士和“电子信息”专业学位硕士授权点。现有专任教师36人，教授6人，副教授14人，国家万人计划教学名师1人，全国模范教师1人，全国优秀教师1人，具有海外留学经历教师10人。教师队伍中含国家标委会成员 4人、质检行业 10 人。
